Laboratorier for biologi og molekylærbiologi

Cellelaboratoriet

Cellelaboratoriet er fullt utstyr for dyrking av celler i kultur. Laboratoriet er inndelt i separate soner for dyrking av mammalske celler, fiskeceller og parasitter. Laboratoriet er lokalisert i nærheten av nedstrøms analyseinstrument som for eksempel flow cytometre og mikroskop.

Kontaktperson: Julie Nikolaisen og Hanne Røland Hagland (Seahorse)

Flow cytometri

Ved bruk av hydrodynamisk fokusering passerer cellene en og en gjennom en laserstråle, og ved å måle spredning av lys og fluorescence intensitet får en data som forteller om cellenes størrelse, granularitet og relativt nivå av fluorescerende markører.  Det er også mulighet for sortering av celler, da kan eksempelvis cellepopulasjoner eller enkeltceller av interesse selekteres og separeres ut for videre dyrkning eller nedstrøms analyser.  

Kontaktpersoner: Hanne Røland Hagland og Krista Michelle Kaster

Sekvensering

Ofte vil templat-DNA bli delt i små biter som amplifiseres, og deretter vil alle disse små bitene sekvenseres i et så stort omfang, at man kan “lese” hele genomet (whole genome sequencing, WGS) eller de delene av genomet man ønsker å sekvensere (targeted sequencing, som f.eks hotspot mutasjoner i kreftforsknings/diagnose) i en gitt organisme. Tredjegenerasjons sekvensering, også kalt long-read sequencing, benyttes hovedsakelig for å sekvensere nukleotidene i lange sekvenser, uten å måtte dele templatet opp i små biter. Det finnes ulike plattformer og leverandører av andre- og tredjegenerasjons sekvenseringsmetoder. Disse skiller seg fra hverandre både med tanke på metoder, lengde av sekvenserte templater, og hvilken man benytter er avgjørende i forhold til resultatene og videre analyser man kan benytte seg av.  Våre plattformer er Illumina (andregenerasjon) og Oxford Nanopore (tredjegenerasjons sekvensering). 

Kontaktperson: Dugassa Nemie Feyissa

Sebrafisklaboratoriet 

Utstyret og ressurser på sebrafisklaboratoriet inkluderer et topp-moderne gjennomstrømmingsakvarium med individuelle tanker til både oppdrett og gytende sebrafisk, og gir en mulighet til å ha transgenetiske fiskelinjer.

Et stereomikroskop med temperaturkontrollert varmeelement, og høydefinisjons kamera som kan brukes til å ta opp video, inkludert fluorescens, og en datamaskin som kan prosessere store videofiler er også tilgjengelig. En mikroinjektor er koblet til stereomikroskopet og gjør det mulig å manipulere sebrafiskembryoer (mikroRNA- og morpholinoinjeksjon) samt kjemikaliedosering for å simulere føtomaternell overføring. Til arbeid med tidlige livsstadier finnes det en temperaturkontrollert inkubator hvor en kan regulere livssyklusen. Sebrafisklaboratoriet blir benyttet innen forskning og undervisning

Kontaktpersoner: Daniela Maria Pampanin and Federico Fenaroli